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Bei ihrem Treffen am 18. Juni 2001 an der Albert-Ludwigs Universität Freiburg haben die Vertreter der sieben EUCOR Universitäten die Idee einer Sommeruniversität entwickelt, um damit den Willen zu bekunden, gemeinsam ein erstes Projekt in den Umweltwissenschaften zu realisieren.

Die erste EUCOR-Sommeruniversität hat 2004 in Bad Herrenalb (DE) im Schwarzwald stattgefunden. Die Veranstaltung wurde von der Universität Karlsruhe (TH) getragen. Nach zwei Jahren Vorbereitung durch eine interdisziplinäre wissenschaftliche und logistische Arbeitsgruppe hat der Erfolg der Veranstaltung die Zusammenarbeit im Bereich Umweltwissenschaft im Rahmen von EUCOR deutlich verbessert.

Bei der 2. Auflage 2006 in Mittelwihr (FR) im Elsass haben sich die Verantwortlichen auf die Erfahrungen der ersten Sommeruniversität gestützt und das Konzept weiterentwickelt. Administrativ verantwortlich war 2006 die Universität Louis Pasteur.